CistromeDB: Cistrome Data Browser
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| 運用機関名: | Cistrome Project |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | 公開されているChIP-seqやDNase-seqのデータセットのポータルブラウザーです。生物種、文献の情報等データセットについて手動でキュレーションされた情報、各サンプルを均一なパイプラインで分析した結果、読み取りレベル、注釈レベルなど各データセットの品質管理情報と、これらのデータセットを分析、視覚化できる機能を提供しています。遺伝子名やヒストン修飾検出抗体などにより絞り込み、複数のデータについてWashU BrowserやUCSC Browserで表示することが可能です。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://dc2.cistrome.org/#/bdown |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://dc2.cistrome.org/#/bdown |
| データベースの使い方 | http://dc2.cistrome.org/#/documents |
| データベースの連絡先: | https://liulab-dfci.github.io/contact |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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GeneProf GWIPS-viz ChIP-Atlas NGS-QC Trips-Viz doRiNA Networks of Functional Coupling of proteins D3G piRTarBase Cell Signaling Technology Pathway Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-03-17 |
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レコード最終更新日:
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2020-03-17 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |