EnhancerAtlas 2.0
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| 運用機関名: | Johns Hopkins School of Medicine |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | エンハンサーアノテーションを提供するデータベースです。 ヒト（hg19）、マウス（mm9）、ハエ（dm3）、線虫（ce10）、ゼブラフィッシュ（danRer10）、ラット（rn5）、酵母（sacCer3）、ニワトリ（galGal4）、ブタ (susScr3) の9種のモデル生物について、複数のハイスループット実験データセット (ヒストン修飾、CAGE、GRO-seq、転写因子結合、DHSなど) に基づいて予測したコンセンサス エンハンサーを収録しています。このデータベースにより、（1）特定のゲノム領域で予測されるエンハンサーの実験的証拠の調査、（２）異なる細胞/組織タイプ間でのエンハンサーの比較、（３）特定の遺伝子に関連するエンハンサーの特定、（４）調節エレメントの予測ができます。 |
| 生物種: | , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性 |
| タグ (データの種類): | 発現, 分布 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.enhanceratlas.org/downloadv2.php |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | http://www.enhanceratlas.org/helpv2.php |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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SAGD MitoGenesisDB SNP2APA Tree Shrew Database DBH2H カイコ参照トランスクリプトームデータ HACER Melonet DB ViBrism Database ViBE-Z |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2022-04-28 |
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レコード最終更新日:
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2022-04-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |