VISDB: Viral Integration Site DataBase
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| 運用機関名: | University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth) |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | ヒトゲノムに組み込まれたウィルスの統合位置と関連情報のデータベースです。 5 つの DNA 腫瘍ウィルス (HBV、HPV、EBV、MCV、AAV2) と 4 つの RNA レトロウィルス (HIV、MLV、HTLV、XMRV) を含む、9 つの主要なウィルスをカバーしています。 データは文献からキュレートしており、各エントリには、融合ウィルスとホスト、検証の有無、検出方法、サンプルタイプ (腫瘍、非腫瘍)、疾患、ウィルス配列、宿主配列、標的遺伝子を制御するための miRNA、上流および下流の配列 などを収録しています。 |
| 生物種: | , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, RNA, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://bioinfo.uth.edu/VISDB/index.php/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://bioinfo.uth.edu/VISDB/public/archives/Manual.pdf?csrt=10859936412756757940 |
| データベースの連絡先: | https://bioinfo.uth.edu/VISDB/index.php/help?csrt=10859936412756757940#contact-us-page |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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VIRsiRNAdb miRNEST LncBook 下痢症ウイルスデータベース Ebola and Hemorrhagic Fever Virus Database SyntDB LncACTdb 3.0 EDK Cancer Genome Mine Viral Probe Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2022-04-13 |
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レコード最終更新日:
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2022-04-13 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |