pATLAS: Plasmid Atlas
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| 運用機関名: | Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa |
| 運用機関所在国・地域: | ポルトガル |
| 説明: | NCBI RefSeqに登録されているプラスミドとそのメタデータを検索できるデータベースです。プラスミド名、生物種、抗生物質耐性、病原性、プラスミドファミリー、配列長、類似性による検索が可能で、プラスミド間の関係を可視化することができます。また外部パイプラインによって同定されたプラスミドセットをプラスミドネットワークに表示することもできます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, cDNA/EST, DNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 相互作用/パスウェイ, 書誌/ドキュメント |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://patlas.gitbook.io/docs/usage |
| データベースの連絡先: | https://gitter.im/plasmidATLAS/Lobby |
| API / SPARQL endpoint: | https://patlas.gitbook.io/docs/api |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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PLSDB addgene DNASU Plasmid Repository NBRP Yeast Transmembrane Helices in Genome Sequences Database of genomes and transcriptional regulations for filamentous fungi Escherichia coli O157:H7 Sakai WebGeSTer DB - A Transcription Terminator Database PlasmID BCCM/GeneCorner Plasmid Collection |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-04-14 |
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レコード最終更新日:
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2020-04-14 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |