Pancan-meQTL: Pan-cancer methylation quantitative trait loci
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| 運用機関名: | 華中科技大学, University of Texas Health Science Center at Houston |
| 運用機関所在国・地域: | 中国, アメリカ合衆国 |
| 説明: | ゲノム全体の遺伝子型と統合したDNAメチル化の量的形質遺伝子座 (meQTL) を提供するデータベースです。ゲノムのメチル化レベルに対するSNPの影響を体系的に予測する目的で作成されました。Cancer Genome Atlas（TCGA）による遺伝子型とメチル化データを使用し、異なる種類のがんを対象として、cis-meQTLやtrans-meQTLの情報を提供します。各エントリにはSNP ID、SNPの位置、変異塩基、メチル化プローブ、メチル化位置、遺伝子名、P-valueなどを収録しています。さまざまな種類のがんにわたる患者の全生存率についてmeQLTやGWAS連鎖不均衡（LD）領域におけるmeQLTの閲覧、検索も可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, エピジェネティクス, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 表現型, 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://bioinfo.life.hust.edu.cn/Pancan-meQTL/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | http://bioinfo.life.hust.edu.cn/Pancan-meQTL/contact |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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EWAS Atlas iMETHYL QTLbase ncRNA-eQTL SNP2APA CancerSplicingQTL Cell Model Passports HaploReg DBKERO MIAMI |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-01-21 |
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レコード最終更新日:
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2020-01-21 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |