FusionGDB2: Fusion Gene annotation DataBase
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| 運用機関名: | University of Texas Health Science Center at Houston |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | がんに関わる融合遺伝子のデータベースです。 Entrez mRNA sequence librariesとChiTars 5.0 、ChimerDB 4.0から得られたTCGAデータをもとに、融合遺伝子の概要、遺伝子オントロジー、ORF情報、アミノ酸配列や塩基配列、タンパク質相互作用、関連する薬剤と疾患の情報を収録しています。FusionAI のディープラーニングによる染色体切断傾向の情報やFGviewerにより可視化したタンパク質レベルでの融合パートナー遺伝子の保持情報も付加しています。 FusionGDB（https://ccsm.uth.edu/FusionGDB/ ）の後継サイトです。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, DNA, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://compbio.uth.edu/FusionGDB2/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://compbio.uth.edu/FusionGDB2/help.html |
| データベースの連絡先: | https://compbio.uth.edu/FusionGDB2/contact.html |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Transmembrane Helices in Genome Sequences CREEDS MSigDB Oncomine PROkariotIC Database Of Gene-Regulation FlyFactorSurvey HACER RhesusBase Autism Knowledgebase Tumor Associated Gene database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-10-23 |
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レコード最終更新日:
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2022-07-21 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |