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Bgee DataBase for Gene Expression Evolution:  Bgee

info ID: NBDC01723
info 名称: Bgee DataBase for Gene Expression Evolution
info 別称: Bgee
info URL: 
info 運用機関名: BGEE administrators
info 運用機関所在国・地域: スイス
info 説明: 複数のデータタイプ（bulk RNA-Seq、scRNA-Seq、Affymetrix、in situ ハイブリダイゼーション、および EST データ）から作成された複数の動物種の遺伝子発現パターンを検索･比較するためのデータベースです。正常な遺伝子の発現に関する比較の基準を提供するため、本データベースでは健康的で野生型の発現データのみを選定しています（例：遺伝子ノックアウトなし、治療なし、疾患なし）。発現の有無、および過剰/過小発現の差異に、遺伝子のオーソロジーに関する情報および器官間のホモロジーに関する情報を合して呼び出します。これにより、異なる種間の発現パターンの比較が可能となります。
info 生物種: Anolis carolinensis (), Bos taurus (), Caenorhabditis elegans (), Danio rerio (), Drosophila melanogaster (), Gallus gallus (), Gorilla gorilla gorilla (), Homo sapiens (), Macaca mulatta (), Monodelphis domestica (), Mus musculus (), Ornithorhynchus anatinus (), Pan paniscus (), Pan troglodytes (), Rattus norvegicus (), Sus scrofa (), Xenopus tropicalis (), Canis lupus familiaris (), Felis catus (), Equus caballus (), Capra hircus (), Ovis aries (), Oryctolagus cuniculus (), Cavia porcellus (), Meleagris gallopavo (), Callithrix jacchus (), Cercocebus atys (), Macaca fascicularis (), Macaca nemestrina (), Papio anubis (), Gorilla gorilla (), Microcebus murinus (), Chlorocebus sabaeus (), Manis javanica (), Heterocephalus glaber (), Xenopus laevis (), Anolis carolinensis (), Lepisosteus oculatus (), Anguilla anguilla (), Astyanax mexicanus (), Esox lucius (), Salmo salar (), Gadus morhua (), Poecilia reticulata (), Oryzias latipes (), Astatotilapia calliptera (), Neolamprologus brichardi (), Scophthalmus, maximus (), Gasterosteus aculeatus (), Nothobranchius furzeri (), Branchiostoma , lanceolatum (), Latimeria chalumnae (), Drosophila pseudoobscura (), Drosophila simulans ()
info タグ （対象）: ゲノム/遺伝子, 個体/種
info タグ (データの種類): 発現, 分布, 分類
info 論文等 (PubMed ID/DOI): 
PubMed ID:
23487185
DOI:
-
PubMed ID:
25009735
DOI:
-
PubMed ID:
22285560
DOI:
-
info 言語: 英語
info 稼動状況: 稼動中
info 一括ダウンロードデータへのリンク: ―
info 一括ダウンロードデータのデータ説明: ―
info データベースの利用許諾へのリンク: ―
info データベースの使い方 ―
info データベースの連絡先: Bgee[at]sib[dot]swiss
info API / SPARQL endpoint: https://www.bgee.org/sparql/
info LSDBアーカイブへのリンク: ―
info MEDALSデータベース便覧へのリンク: ―
info 統合TVへのリンク:
info FAIRsharingへのリンク:
info 類似データベース: e-Mouse Atlas of Gene Expression
SAGD
Haemosphere
Melonet DB
TodoFirGene
DropViz
MitoGenesisDB
PmiREN
ViBE-Z
MOROKOSHI Sorghum transcriptome database
info レコード管理者:
info レコードの由来: FAIRsharing Logo(2018-12-21)
info レコード公開日: 2019-03-28
info レコード最終更新日: 2024-04-08
info 本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license