miRBase: microRNA database
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| 運用機関名: | Faculty of Life Sciences (The University of Manchester) |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 公開されているmicroRNAの配列について、配列から予測されるmiRNA前駆体のヘアピン構造(mirで示されます)、成熟miRNAの配列(miRで示されます)、文献情報等が登録されています。様々な検索機能が用意されており、キーワード検索、ゲノム位置による検索、クラスター検索、発現実験による検索、ユーザ自身の配列による検索が行えます。全ての配列とアノテーションはダウンロード可能です。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | RNA |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://mirbase.org/ftp.shtml |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ftp://mirbase.org/pub/mirbase/CURRENT/LICENSE |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=miRBase |
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000569 |
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類似データベース:
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Noncoding RNA database The European ribosomal RNA Database Database of small human non-coding RNAs tRNAdb PmiRKB UTRdb worm UTRome GtRNAdb 機能性RNAゲノムブラウザー Project Specific Custom Tracks - ncRNA.org |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2022-01-24 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |